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Biologie végétale à la conférence Belyaev – 2017

Ce numéro thématique de BMC Biologie Végétale poursuit la série de numéros spéciaux post-conférence de BioMed Central présentant les documents des conférences sur la bioinformatique et la biologie des systèmes collectivement connues sous le nom de BGRSSB (Bioinformatics of Genome Regulation and StructureSystems Biology) tenues à Novossibirsk. Il contient les articles discutés lors de la conférence internationale « Belyaev Readings - 2017 » (BR-2017) (http://conf.bionet.nsc.ru/belyaev100/en) et de la Young Scientists School « Systems Biology and Bioinformatics - 2017 » ( SBB-2017) (http://conf.bionet.nsc.ru/sbb2017/en/).

L'année 2017 marque le 100e anniversaire de la naissance du membre à part entière de l'Académie des sciences de l'URSS, le professeur Dmitry K. Belyaev (1917-1985), un scientifique, évolutionniste et généticien exceptionnel. En vue de cette date mémorable, l'Institut de cytologie et de génétique de la branche sibérienne de l'Académie des sciences de Russie (ICG SB RAS) a organisé la Conférence internationale Belyaev sur la génétique et l'évolution (Novosibirsk, 7-10 août 2017).

La conférence commémorative Belyaev-2017 a poursuivi les traditions des séries de conférences BGRSSB et PlantGen comprenant plusieurs sections scientifiques, dont la biologie végétale. Au cours des deux dernières décennies, depuis 1998, la série BGRS/SB a acquis une réputation de lieu de rencontre privilégié en Russie pour les biologistes, informaticiens, mathématiciens et biochimistes travaillant dans le domaine de la biologie des systèmes interdisciplinaire, se concentrant désormais davantage sur la biologie végétale informatique.

La section sur la biologie végétale à la conférence Belyaev-2017 était consacrée aux approches génomiques et post-génomiques pour l'analyse de l'organisation des génomes végétaux, le développement d'applications de séquençage et de génotypage pour les plantes, avec un accent particulier sur les cultivars importants.

L'événement Plant-Gen-2017 à Almaty, au Kazakhstan (http://primerdigital.com/PlantGen2017/en/) a réuni à la fois les scientifiques internationaux et les membres du comité de la section Biologie végétale de la conférence Belyaev-2017 de Novossibirsk, rejoignant ainsi la recherche efforts deux plus grands pays post-soviétiques et assurer l'échange d'expertise en génétique végétale. BMC Plant Biology a publié un numéro thématique spécial présentant les documents de l'événement PlantGen-2017 (https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/supplements/volume-17-supplement-1).

Numéros spéciaux déjà publiés de BMC Biologie Végétale et BMC Evol Biol a couvert le déroulement de la conférence BGRSSB-2016 et de l'école SBB-2015 à Novossibirsk [1,2,3,4] ainsi que l'événement BGRSSB-2014 (https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/supplements/ volume-15-supplément-12).

En 2017, le « Vavilov Journal of Selection and Breeding » a publié une série de mémoires sur le professeur Belyaev (http://vavilov.elpub.ru/jour/issue/view/32/showToc). L'article de V.K. Shumny [5] raconte l'histoire de la vie de Belyaev, tandis que d'autres publications discutent de l'importance des travaux de Belyaev sur la théorie de l'évolution et de la domestication. Le matériel sur la biologie végétale discuté lors de la conférence Belyaev-2017 a été en partie publié en russe dans le prochain numéro de "Vavilov Journal of Selection and Breeding" (http://vavilov.elpub.ru/jour/issue/view/33/showToc) .

Le numéro actuel étend la gamme de publications révolutionnaires sur une variété de cultures agricoles, notamment la pomme de terre, le lin et le blé, et met en évidence le domaine de la résistance aux agents pathogènes chez les plantes.

Olesya Y. Shoeva et ses co-auteurs [6] ont systématiquement passé en revue les facteurs environnementaux affectant les gènes de la voie de biosynthèse des anthocyanes chez les plantes. Chez diverses plantes, les forces relatives de la pression sélective diffèrent, les gènes des dicotylédones subissant une pression plus forte que chez les monocotylédones, et chez les plantes dépendantes des pollinisateurs davantage que chez les espèces indépendantes des pollinisateurs. Cette observation met en évidence un rôle important de la pollinisation dépendante des insectes dans l'évolution du réseau de gènes de biosynthèse des anthocyanes.

Les sujets de recherche des prochains articles examinent les caractéristiques agricoles importantes des plantes supérieures. Les morphotypes de blé avec une morphologie de l'épi altérée associée au développement d'épillets surnuméraires présentent une ressource génétique importante pour les études sur la régulation génétique du développement de l'inflorescence.

Oxana B. Dobrovolskaya et ses collègues [7] ont caractérisé des lignées de blé diploïdes et tétraploïdes de divers morphotypes d'épis non standard, ce qui a permis d'identifier un nouvel allèle mutant du PANICULE FRISÉE DE BLÉ (WFZP) gène qui détermine la ramification des épis chez le blé diploïde Ttiticum monococcum L. Les mutants d'épillets surnuméraires représentent un outil génétique important pour la recherche sur le développement de l'épillet de blé et pour l'identification des gènes qui contrôlent les activités des méristèmes. Les auteurs montrent que les gènes FRIZZY PANICLE et SHAM RAMIFICATION2 régulent indépendamment la différenciation des méristèmes floraux chez le blé.

Alexey A. Dmitriev et ses co-auteurs [8] ont considéré la résistance aux agents pathogènes du lin (Linum usitatissimum L.), une plante cultivée utilisée pour la production de fibres et d'huile. Grâce au séquençage à haut débit, les gènes impliqués dans la réponse de défense précoce du lin contre le champignon Fusarium oxysporum ont été identifiés. Les changements dans l'expression des gènes liés à la pathogenèse et des gènes impliqués dans la production de ROS ou liés à la biogenèse de la paroi cellulaire sont rapportés.

L'article d'Alex V. Kochetov et al. [9] dissèque les principaux gènes de résistance aux nématodes de la pomme de terre par une analyse comparative des transcriptomes racinaires de Solanum phureja génotypes à résistance contrastée Globodera rostochiensis. Il a été démontré précédemment que les gènes de répétition riche en leucine (NBS-LRR) du site de liaison aux nucléotides composent la plus grande famille de gènes de résistance des plantes, représentant environ 80 % des gènes de résistance connus. La combinaison de l'analyse transcriptomique avec des données sur les gènes prédits de la pomme de terre codant pour le NBS-LRR a considérablement amélioré les résultats. Les auteurs ont discuté des gènes candidats qui fournissent S. phureja avec une forte résistance au nématode à kyste doré de la pomme de terre.

Saule Abugalieva et ses collègues [10] ont effectué une réévaluation taxonomique des spécimens de Allium sous-genre Reticulatobulbosa collectés en Asie centrale selon les séquences d'espaceurs transcrits en interne et de marqueurs matK. Leur analyse a solidement confirmé l'origine monophylétique de la Allium espèce. L'étude contribue à la clarification de la taxonomie dans Allium.

L'article de Maria D. Logacheva et al. [11] discute des événements évolutifs qui ont façonné les plastomes des fougères polypodes (Polypodiales). Les génomes hloroplastes (plastomes) des plantes terrestres sont généralement conservés, ayant une vitesse lente d'évolution de la séquence et de la structure. Les auteurs ont caractérisé les génomes des plastes de trois espèces de Dryopteris, qui est l'un des plus grands genres de fougères, et a effectué une analyse comparative de leur ADN chloroplastique enrichi des plastomes disponibles de Polypodiales, le groupe de fougères le plus riche en espèces. Les auteurs soutiennent que les répétitions inversées des plastomes de Polypodiales sont un système génétique dynamique constamment remanié par la perte de gènes, la duplication et le transfert latéral putatif des mitochondries.

Ćilerdžić et ses collègues [12] discutent de la dégradation de la lignine par les enzymes fongiques. Composante structurelle de la biomasse végétale, la lignocellulose, est la ressource renouvelable la plus abondante dans la nature. Sa délignification dépend de manière critique des champignons de la pourriture blanche en raison de leur système enzymatique ligninolytique puissant. Les auteurs examinent les différences de potentiel ligninolytique des espèces fongiques et présélectionnent les meilleurs candidats pour l'ingénierie pour une variété de processus biotechnologiques impliquant la biotransformation de résidus/déchets de lignocellulose.

À la fin de ce numéro spécial, deux articles sur les nouvelles techniques d'analyse génétique chez les plantes sont présentés.

Satyvaldy Jatayev et ses co-auteurs [13] ont fourni à la communauté scientifique une technique améliorée de génotypage des plantes. L'introduction généralisée de systèmes de génotypage basés sur les SNP à faible et à haut débit a formé une corne d'abondance d'applications potentielles. Dans leur article, Jatayev et al. présenter la rentabilité du système de type Amplifluor (amplification avec fluorescence) pour le génotypage SNP des génomes végétaux.

Enfin, Bykova et al. [14] ont présenté le phénotypage des SNP sur puce de la résistance à la tache tachetée de l'orge. Tache tachetée, causée par Cochliobolus sativus, est l'une des maladies les plus répandues et les plus nuisibles chez l'orge. L'étude a utilisé le test 50 K Illumina Infinium iSELECT et la collecte de carottes d'orge de printemps pour identifier trois loci génomiques conférant une résistance aux plantules à deux C. sativus.

Nous espérons que le lectorat de BMC Plant Biology trouvera cette collection d'articles intéressante et utile.


Les références

Orlov YL, Baranova AV, Hofestadt R, Kolchanov NA. Génomique computationnelle à BGRSSB-2016 : note d'introduction. BMC Génomique. 201617(Suppl 14):996.

Orlov YL, Baranova AV, Markel AL. Modèles informatiques en génétique au BGRSSB-2016 : note introductive. BMC Genet. 201617 (Suppl 3):155.

Baranova AV, Orlov YL. Biologie évolutive à BGRSSB-2016. BMC Evol Biol. 201717(Suppl 1) :21.

Orlov YL, Baranova AV, Salina EA. Biosciences computationnelles des plantes à BGRSSB-2016 : note d'introduction. BMC Végétal Biol. 201616 (Suppl 3) : 243.

Orlov YL, Baranova AV, Herbeck YE. Biologie évolutive à la conférence Belyaev - 2017. BMC Evol Biol. 201717 (Suppl 2) : 260.

Orlov YL, Baranova AV, Tatarinova TV, Kolchanov NA. Génétique à la conférence Belyaev - 2017 : note introductive. BMC Genet. 201718(Suppl 1):116.

Orlov YL, Baranova AV, Chen M, Salina EA. Biologie végétale à la conférence Belyaev - 2017. BMC Plant Biol. 201717 (Suppl 2) : 257.

Dresvyannikova AE, Watanabe N, Muterko AF, Krasnikov AA, Goncharov NP, Dobrovolskaya OB. Caractérisation d'une mutation dominante pour le trait sans ligule : Aegilopstauschiiliguleless (Lg t ). BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).

Dobrovolskaya OB, Amagai Y, Popova KI, Dresvyannikova AE, Martinek P, Krasnikov AA, Watanabe N. Genes WHEAT FRIZZY PANICLE et SHAM RAMIFICATION 2 régulent indépendamment la différenciation des méristèmes floraux du blé. BMC Végétal Biol. 201717 (Suppl 2) : 252. https://doi.org/10.1186/s12870-017-1191-3.

Dobrovolskaya O, Pont C, Sibout R, Martinek P, Badaeva E, Murat F, Chosson A, Watanabe N, Prat E, Gautier N, Gautier V, Poncet C, Orlov YL, Krasnikov AA, Bergès H, Salina E, Laikova L , Salse J. FRIZZY PANICLE entraîne des épillets surnuméraires dans le blé tendre. Physiol végétal. 2015167(1) :189-99. https://doi.org/10.1104/pp.114.250043.

Strygina KV, Khleskina EK. Facteurs transcriptionnels de type Myc chez le blé : organisation structurelle et fonctionnelle des membres de la sous-famille I. BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).

Gordeeva EI, Glagoleva AY, Kukoeva TV, Khlestkina EK, Shoeva OY. Orge à grain violet (Hordeumvulgare L.) : développement assisté par marqueurs de NIL pour étudier les particularités du réseau de régulation de la biosynthèse des anthocyanes. BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).

Makarenko MS, Usatov AV, Tatarinova TV, Azarin KV, Logacheva MD, Gavrilova VA, Horn R. Caractérisation du génome mitochondrial du type MAX1 du tournesol mâle-stérile cytoplasmique. BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).

Dmitriev AA, Krasnov GS, Rozhmina TA, Zyablitsin AV, Snezhkina AV, Fedorova MS, Pushkova EN, Kezimana P, Novakovskiy RO, Povkhova LV, Smirnova MI, Muravenko OV, Bolsheva NL, Kudryavtseva AV, Melnikova NV. Lin (Linumusitatissimum L.) réponse à une acidité du sol non optimale et à une carence en zinc. BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).

Klepikova AV, Kulakovskiy IV, Kasianov AS, Logacheva MD, Penin AA. Une mise à jour de la base de données TraVA : réponse au stress au froid spécifique à un organe dans Arabidopsis thaliana. BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).

Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. L'évolution des réseaux de régulation des gènes contrôlant Arabidopsis thaliana Développement de L. trichome. BMC Végétal Biol. 201919(Suppl 1).


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Éditeurs

Andreï V. Vassiliev
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie Département d'embryologie, Université d'État Lomonossov de Moscou, Moscou, Russie

Irina Yu. Baklouchine
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Yegor S. Vassetzky
Dr Sci. (Biol.), CNRS UMR9018, Institut Gustave Roussy, Villejuif, France Koltzov Institute of Developmental Biology of the Russian Academy of Sciences, Moscou, Russie

Yulia A. Kraus
PhD (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie

Igor I. Adameiko
Dr Sci. (Biol.), Département de physiologie et de pharmacologie, Karolinska Institutet, Stockholm, Suède Laboratoire de recherche sur l'embryogenèse, Université de médecine de Vienne, Autriche
Iouri D. Bogdanov
Dr Sci. (Biol.), Université de Southampton, Grande-Bretagne
Varvara E. Diakonova
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Tatyana A. Ezhova
Dr Sci. (Biol.), Université d'État de Moscou, Faculté de biologie, Département de génétique, Moscou, Russie
Grigori N. Enikolopov
PhD (Biol.), Stony Brook University, Stony Brook, NY, USA Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, USA
Alexandre V. Ereskovky
Dr Sci. (Biol.), Institut Méditerranéen de la Biodiversité et de l'Ecologie Marine et Terrestre (IMBE), Aix Marseille Université, CNRS, IRD, Avignon Université, Marseille, France St.-Petersburg State University, Faculté de Biologie, Département d'Embryologie Institut Koltzov du Développement Biologie de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Oleg A. Gusev
PhD (Biol.), Institute of Fundamental Medicine and Biology of Kazan Federal University RIKEN Innovation Center, Yokohama, Japon
Roman P. Kostyuchenko
PhD (Biol.), Université d'État de Saint-Pétersbourg, Faculté de biologie, Département d'embryologie, Saint-Pétersbourg, Russie
Georgy S. Levit
Dr Sci. (Biol.), Université nationale de recherche en technologie de l'information, mécanique et optique de Saint-Pétersbourg (ITMO), Saint-Pétersbourg, Russie
Victor S. Mikhaïlov
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Galina E. Onischenko
Dr Sci. (Biol.), Université d'État de Moscou, Faculté de biologie, Département de biologie cellulaire et d'histologie, Moscou, Russie
Daria V. Onitschouk
Dr Sci. (Biol.), Département de biologie du développement, Institut de biologie I, Faculté de biologie, Université de Fribourg, Fribourg, Allemagne Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Nikolay D. Ozernyuk
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Marguerite V. Remizova
PhD (Biol.), Université d'État de Moscou, Faculté de biologie, Département des hautes plantes, Moscou, Russie
Sergueï V. Rojnov
Dr Sci. (Biol.), Institut de paléontologie de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Oleg L. Serov
Dr Sci. (Biol.), Institut de cytologie et de génétique, branche sibérienne de l'Académie des sciences de Russie, Novossibirsk, Russie
Alexei N. Tomilin
Dr Sci. (Biol.), Institut de cytologie de l'Académie des sciences de Russie, Saint-Pétersbourg, Russie
Andrey G. Zaraisky
Dr Sci. (Biol.), Institut Shemyakin-Ovchinnikov de chimie bioorganique de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie

Maria A. Alexandrova
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Vsevolod Ya. Brodsky
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Scott F. Gilbert
PhD, professeur de biologie Swarthmore, Pennsylvanie, États-Unis
Vladimir A. Golichenkov
Dr Sci. (Biol.), Faculté de biologie, Université d'État de Moscou, Moscou, Russie
Eleonora N. Grigoryan
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Victor B. Ivanov
Dr Sci. (Biol.), Département de physiologie des racines, Institut Timiryazev de physiologie végétale, Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Alexey M. Koulikov
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Irina V. Lyadova
Dr Sci. (Méd.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Alexandre V. Markov
Dr Sci. (Biol.), Université d'État Lomonossov de Moscou, Faculté de biologie, Moscou, Russie
Alexeï M. Olovnikov
PhD (Biol.), Institut de physique biochimique de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Dmitri A. Sakharov
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Natalya P. Sharova
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Olga B. Simonova
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Olga G. Stroeva
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Victor S. Tarabykine
Dr Sci. (Biol.), Institut de biologie cellulaire et de neurobiologie, Charité, Berlin, Allemagne Lobachevsky State University of Nizhny Novgorod, Nizhny Novgorod, Russie
Mikhaïl V. Ougriumov
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
Suren M. Zakian
Dr Sci. (Biol.), The Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novossibirsk, Russie
Igor S. Zakharov
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie

Elena D. Gasilo
Dr Sci. (Biol.), Institut Koltzov de biologie du développement de l'Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie


Éditeurs

Alexandre A. Makarov
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Institut Engelhardt de biologie moléculaire, Moscou, Russie
RÉDACTEURS EN CHEF ADJOINTS
Vadim L. Karpov
Dr Sci. (Biol.), Prof., Membre Correspondant de l'Académie des Sciences de Russie, Institut Engelhardt de Biologie Moléculaire, Moscou, Russie
Vladimir S. Prasolov
Dr Sci. (Biol.), Prof., Engelhardt Institute of Molecular Biology, Moscou, Russie
ÉDITEUR EXÉCUTIF
Tatiana A. Pronina
Cand. Sci. (Biol.), Institut panrusse d'information scientifique et technique (VINITI), Moscou, Russie
COMITÉ ÉDITORIAL
Anna V. Baranova
Dr Sci. (Biol.), Prof., Université George Mason, École de biologie des systèmes, Fairfax, États-Unis
Petr M. Chumakov
Dr Sci. (Biol.), Prof., Membre Correspondant de l'Académie des Sciences de Russie, Institut Engelhardt de Biologie Moléculaire, Moscou, Russie
Vladimir G. Debabov
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Centre national de recherche & ldquoKurchatov Institute &rdquo &ndash Institut de recherche pour la génétique et la sélection des micro-organismes industriels, Moscou, Russie
Olga A. Dontsova
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Institut Belozersky de biologie physico-chimique, Université d'État Lomonossov de Moscou, Moscou, Russie
Olga O. Favorova
Dr Sci. (Biol.), Prof., Pirogov Russian National Research Medical University, Moscou, Russie
Alexeï V. Finkelshtein
Dr Sci. (Phys.-Math.), Prof., Membre à part entière de l'Académie des sciences de Russie, Institut de recherche sur les protéines, Pushchino, Russie
Mikhaïl S. Gelfand
Dr Sci. (Biol.), Prof., Institute for Information Transmission Problems, Moscou, Russie
Sofia G. Georgieva
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre correspondant de l'Académie des sciences de Russie, Institut de biologie génétique, Moscou, Russie
Marina B. Gottikh
Dr Sci. (Сhem.), Prof., Institut Belozersky de biologie physico-chimique, Moscou, Russie
Vladimir A. Gvozdev
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre à part entière de l'Académie des sciences de Russie, Centre national de recherche & ldquo Institut Kurchatov & rdquo & ndash Institut de génétique moléculaire, Moscou, Russie
Sergueï N. Kochetkov
Dr Sci. (Chem.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Institut Engelhardt de biologie moléculaire, Moscou, Russie
Dmitri V. Kuprash
Dr Sci. (Biol.), Prof., Membre Correspondant de l'Académie des Sciences de Russie, Institut Engelhardt de Biologie Moléculaire, Moscou, Russie
Olga I. Lavrik
Dr Sci. (Chem.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Institut de biologie chimique et de médecine fondamentale, Novossibirsk, Russie
Dmitry A. Los'
Dr Sci. (Biol.), Prof., Membre Correspondant de l'Académie Russe des Sciences, Institut Timiryazev de Physiologie Végétale, Moscou, Russie
Sergueï A. Loukianov
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Université nationale de médecine de recherche Pirogov, Moscou, Russie
Sergueï A. Nedospasov
Dr Sci. (Biol.), Prof., membre titulaire de l'Académie des sciences de Russie, Institut Engelhardt de biologie moléculaire, Moscou, Russie
CONSEIL CONSULTATIF
Grigori N. Enikolopov
Cand. Sci. (Biol.), Prof., Cold Spring Harbor Laboratory, New York, États-Unis
Andreï V. Goudkov
Dr Sci. (Biol.), Prof., Roswell Park Cancer Institute, Buffalo, États-Unis
Alexeï S. Kondrashov
Cand. Sci. (Biol.), Prof., Département d'écologie et de biologie évolutive, Université du Michigan, Ann Arbor, États-Unis Institut Belozersky de biologie physico-chimique, Université d'État de Moscou, Moscou, Russie
Eugène V. Koonin
Cand. Sci. (Biol.), Prof., National Center for Biotechnology Information, Bethesda, États-Unis
Julia G. Kzhyshkowska
Dr Sci. (Biol.), Prof., Universität Heidelberg, Faculté de médecine Mannheim et Clinic Mannheim, Allemagne
Inna N. Lavrik
Dr Sci. (Biol.), Prof., Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Translational Inflammation Research, Magdeburg, Allemagne Centre fédéral de recherche Institut de cytologie et de génétique, Novosibirsk, Russie
Rouslan M. Medzitov
Dr Sci. (Biol.), Prof., Yale University, New Haven, États-Unis
Sergueï M. Mirkin
Dr Sci. (Biol.), Prof., Tufts University, Medford, USA
Eugénie A. Nudler
Dr Sci. (Biol.), Prof., NYU Langone Medical Center, Département de biochimie et de pharmacologie moléculaire, New York, États-Unis Engelhardt Institute of Molecular Biology, Moscou, Russie
Eugène I. Rogaev
Dr Sci. (Biol.), Prof., University of Massachusetts Medical School, Worcester, États-Unis Vavilov Institute of General Genetics, Moscou, Russie
Alexandre Y. Rudensky
Dr Sci. (Biol.), Prof., Howard Hughes Medical Institute and Immunology Program au Sloan Kettering Institute, et Ludwig Center for Cancer Immunotherapy, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, États-Unis
Michael Y. Sherman
Cand. Sci. (Biol.), Prof., Université d'Ariel, Département de biologie moléculaire, Ariel, Israël
Vasily M. Studitsky
Dr Sci. (Biol.), Prof., Cancer Epigenetics Program, Fox Chase Cancer Center, Philadelphie, États-Unis Faculté de biologie, Université d'État de Moscou, Moscou, Russie
Yegor S. Vassetzky
Dr Sci. (Biol.), Institut de Cancérologie Gustave Roussy, Unité Signalisation, noyaux et innovations en oncologie, Villeiuif, France
Marat M. Yusupov
Dr Sci. (Biol.), Prof., Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Strasbourg, France Institut de Médecine et Biologie Fondamentales, Université Fédérale de Kazan (Volga), Kazan, Russie


Département du Trésor des États-Unis

Mise à jour de la liste des ressortissants spécialement désignés

Les personnes suivantes ont été ajoutées à la liste SDN de l'OFAC :

CHERNYKH, Tatiana V (alias CHERNYKH, Tatiana) DOB 25 septembre 1972 nationalité Russie Passeport 712491743 (Russie) expire le 17 novembre 2020 Responsable des relations étrangères chez Izhevsky Mekhanichesky Zavod JSC (individuel) [UKRAINE-EO13661] (Lié à : IZHEVSKY MEKHANICHESKY ZAVOD JSC) .

DEYNEGO, Vladyslav Nykolayevych (alias DEYNEGO, Vladislav Nykolayevich) DDN 12 mars 1964 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

IOFFE, Eduard A (alias IOFFE, Eduard) DDN 07 juin 1970 nationalité Russie Passeport 713023636 (Russie) expire le 20 janvier 2021 Directeur général adjoint des affaires commerciales chez Kalashnikov Concern et Izhevsky Mekhanichesky Zavod JSC (individuel) [UKRAINE-EO13661] (Lié à : KALASHNIKOV CONCERN Lié à : IZHEVSKY MEKHANICHESKY ZAVOD JSC).

KARAMYAN, Vakhtang (alias KARAMIAN, Vakhtang) Date de naissance 19 avril 1991 nationalité Russie Passeport 727409284 (Russie) expire le 28 mars 2023 Directeur du développement commercial au Moyen-Orient chez Kalashnikov Concern (individuel) [UKRAINE-EO13661] (Lié à : KALASHNIKOV CONCERN).

KOFMAN, Aleksandr Igorevich (alias KOFMAN, Oleksandr) DDN 30 août 1977 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

KOZYAKOV, Serhiy (alias KOZYAKOV, Sergey alias KOZYAKOV, Sergey Yurievich) DDN 29 Sep 1982 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

NIKITIN, Vasiliy Aleksandrovich (cyrillique : НИКИТИН, Василий Александрович) (alias NIKITIN, Vasily alias NIKITIN, Vasyl) DDN 25 novembre 1971 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

OLSSON, Sven Anders, Karl X Gustafs Gata 51, Helsingborg 252 40, Suède DDN 1943 (individuel) [UKRAINE-EO13661].

RODKIN, Andrei Nikolaevich (alias RODKIN, Andrei (cyrillique : РОДКИН, Андрей) alias RODKIN, Andrey) DDN 23 septembre 1976 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

TABACHNYK, Dmytro Volodymyrovych (alias TABACHNIK, Dmitry alias TABACHNYK, Dmytriy) DDN 28 novembre 1963 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

TSYPLAKOV, Sergey Gennadevich (alias TSYPLAKOV, Gennady) DDN 01 mai 1983 (individuel) [UKRAINE-EO13660].

ZAKHARCHENKO, Vitaliy Yuriyovych DDN 20 janvier 1963 POB Kostiantynivka, Région de Donetsk, Ukraine (individuel) [UKRAINE-EO13660] (Lié à : YANUKOVYCH, Viktor Fedorovych).

Les entités suivantes ont été ajoutées à la liste SDN de l'OFAC :

AKTSIONERNOE OBSCHESTVO 'YALTINSKAYA KINODSTUDIYA' (alias CJSC YALTA-FILM alias FILM STUDIO YALTA-FILM alias JOINT STOCK COMPANY YALTA FILM STUDIO alias JSC YALTA FILM STUDIO alias KINOSTUDIYA YALTA YALTA-FILM alias FILMAA STUDIO Mukhina, Building 3, Yalta, Crimée 298063, Ukraine Sevastopolskaya 4, Yalta, Crimée, Ukraine Numéro d'enregistrement 30993572 [UKRAINE-EO13685].

AVIA GROUP TERMINAL LIMITED LIABILITY COMPANY (a.k.a. AG TERMINAL OOO a.k.a. LLC AG TERMINAL a.k.a. OBSHCHESTVO S OGRANICHENNOI OTVETSTVENNOSTYU AVIA GRUPP TERMINAL (cyrillique : ОБЩЕСТВО С ТЕРМИНАЛ) ), Ter. ГРУПП Aeroport Sheremetyevo, Khimki, Moscovskaya Oblast 141400, Russie [UKRAINE-EO13661] (Lié à : AVIA GROUP LLC).

CRIMEAN ENTERPRISE AZOV DISTILLERY PLANT (alias Azovsky LIKEROGORILCHANY Zavod, KRYMSKE RESPUBLIKANSKE PIDPRYEMSTVO alias Azovsky LIKEROVODOCHNY ZAVOD alias CRIMEAN REPUBLICAN ENTERPRISE AZOV DISTILLERY alias CRIMEAN REPUBLICAN ENTERPRISE Azovsky LIKEROVODOCHNY ZAVOD alias KRYMSKE RESPUBLIKANSKE PIDPRYEMSTVO Azovsky LIKEROGORILCHANY ZAVOD), Bud. 40 vuls. Zaliznychna, Smt Azovske, Dzhankoisky R-N, Crimea 96178, Ukraine 40 Railway St., Azov, Dzhankoy District 96178, Ukraine 40 Zeleznodorozhnaya str., Azov, Jankoysky District 96178, Ukraine Registration ID 01271681 (Ukraine) [UKRAINE-EO13685].

FENTEX PROPERTIES LTD., Tortola, Îles Vierges britanniques [UKRAINE-EO13661].

INRESBANK OOO (alias INRESBANK LTD alias INVESTITSIONNY RESPUBLIKANSKI BANK OBSHCHESTVO S OGRANICHENNOI OTVETSTVENNOSTYU alias INVESTISSEMENT REPUBLIC BANK LLC f.k.a. OOO KBK BANK, 32, Ulitsa, Ulitsa Bolska 1, Moscou 107023, Russie SWIFT/BIC INKKRUM1 alt. SWIFT/BIC IREPRUMM [UKRAINE-EO13661] (lié à : SMP BANK).

JOINT STOCK COMPANY GENBANK (alias AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO GENBANK (cyrillique : ОБЩЕСТВО ГЕНБАНК) alias CLOSED JOINT STOCK COMPANY GENBANK alias GENBANK, AO (cyrillique : ГЕНБАНК, АО) alias JSC GENBANK), 115sa, Ohneza, 124Stop, Naberskaya, Moscou Simferopol 295011, Ukraine Site Web SWIFT/BIC GEOORUMM www.genbank.ru Adresse e-mail [email protected] Identifiant d'enregistrement 113771100074 (Russie) [UKRAINE-EO13685].

JOINT STOCK COMPANY SEVASTOPOLSKY MORSKOY BANK (a.k.a. AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO SEVASTOPOLSKIY MORSKOY BANK a.k.a. AO SEVASTOPOLSKIY MORSKOY BANK a.k.a. JSC SEVASTOPOLSKY MORSKOY BANK), 18a Brestska Street, Sevastopol, Crimea 99001, Ukraine 18/A Ulitsa Brestskaya, Sevastopol, Crimea 299001, Ukraine SWIFT/BIC MORKUAUK Website www.morskoybank.com Email Address [email protected] Registration ID 1149204013397 [UKRAINE-EO13685].

LERMA TRADING S.A., Calle 53a Este, Panama [UKRAINE-EO13661].

LTS HOLDING LIMITED (f.k.a. IPP-INTERNATIONAL PETROLEUM PRODUCTS LTD.), Rue du Conseil-General 20, Geneva 1204, Switzerland Tortola, Virgin Islands, British [UKRAINE-EO13661].

MAPLES SA, Boulevard Royal 25/B 2449, Luxembourg [UKRAINE-EO13661].

OAO VOLGOGRADNEFTEMASH (f.k.a. DOCHERNEE AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO OTKRYTOGO TIPA VOLGOGRADNEFTEMASH ROSSIISKOGO AKTSIONERNOGO OBSHCHESTVA GAZPROM a.k.a. JSC VOLGOGRADNEFTEMASH a.k.a. OTKRYTOE AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO VOLGOGRADNEFTEMASH (Cyrillic: ОТКРЫТОЕ АКЦИОНЕРНОЕ ОБЩЕСТВО ВОЛГОГРАДНЕФТЕМАШ)), 45 Ulitsa Elektrolesovskaya, Volgograd, Volgogradskaya Oblast 400011, Russia [UKRAINE-EO13661] (Linked To: STROYGAZMONTAZH).

OPEN JOINT STOCK COMPANY COMMERCIAL BANK VERKHNEVOLZHSKY (a.k.a. COMMERCIAL JOINT-STOCK BANK VERHNEVOLGSKY a.k.a. OAO KB VERKHNEVOLZHSKIY a.k.a. OJSC CB VERKHNEVOLZHSKY a.k.a. OTKRYTOE AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO KOMMERCHESKIY BANK VERKHNEVOLZHSKIY a.k.a. PUBLIC COMMERCIAL JOINT-STOCK BANK VERHNEVOLZHSKY), Ulitsa Bratyev Orlovykh 1a, Rybinsk, Yaroslavskaya Oblast 152903, Russia Ulitsa Suvorova 39A, Sevastopol, Crimea 299011, Ukraine Pereulok Pionerskiy 5, Simferopol, Crimea 295011, Ukraine SWIFT/BIC VECARU21 alt. SWIFT/BIC VVBKRU2Y Website www.vvbank.ru Email Address [email protected] Registration ID 1027600000185 (Russia) [UKRAINE-EO13685].

OPEN JOINT STOCK COMPANY KRASNODAR REGIONAL INVESTMENT BANK (a.k.a. OAO KRAYINVESTBANK (Cyrillic: ОАО КРАЙИНВЕСТБАНК) a.k.a. OJSC KRAYINVESTBANK a.k.a. OTKRYTOE AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO KRASNODARSKIY KRAEVOY INVESTITSIONNIY BANK (Cyrillic: ОТКРЫТОЕ АКЦИОНЕРНОЕ ОБЩЕСТВО КРАСНОДАРСКИЙ КРАЕВОЙ ИНВЕСТИЦИОННЫЙ БАНК)), Ulitsa Mira 34, Krasnodar 350063, Russia Ulitsa Bolshaya Morskaya 23, Sevastopol, Crimea 299011, Ukraine Ulitsa Dolgorukovskaya/Zhukovskogo/A. Nevskogo 1/1/6, Simferopol, Crimea 295000, Ukraine SWIFT/BIC KRRIRU22 Website www.kibank.ru Email Address [email protected] Registration ID 1022300000029 (Russia) All offices worldwide [UKRAINE-EO13685].

OTKRYTOE AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO VNESHNEEKONOMICHESKOE OBEDINENIE TEKHNOPROMEKSPORT (a.k.a. JOINT STOCK COMPANY FOREIGN ECONOMIC ASSOCIATION TECHNOPROMEXPORT a.k.a. JOINT STOCK COMPANY FOREIGN ECONOMIC ASSOCIATION TEKHNOPROMEXPORT a.k.a. JSC TEKHNOPROMEXPORT a.k.a. JSC VO TEKHNOPROMEXPORT a.k.a. OJSC TECHNOPROMEXPORT a.k.a. OPEN JOINT STOCK COMPANY FOREIGN ECONOMIC ASSOCIATION TEKHNOPROMEXPORT a.k.a. VO TEKHNOPROMEKSPORT, OAO a.k.a. "JSC TPE"), d. 15 str. 2 ul. Novy Arbat, Moscow 119019, Russia Email Address [email protected] Registration ID 1067746244026 (Russia) Tax ID No. 7705713236 (Russia) Government Gazette Number 02839043 (Russia) [UKRAINE-EO13685].

PAO MOSOBLBANK (a.k.a. AKB MOSOBLBANK OAO a.k.a. AKTSIONERNY KOMMERCHESKI BANK MOSKOVSKI OBLASTNOI BANK OTKRYTOE AKTSIONERNOE OBSHCHESTVO a.k.a. PUBLIC JOINT STOCK COMPANY MOSCOW REGIONAL BANK), Ulitsa Semenovskaya B, D. 32, Str. 1, Moscow 107023, Russia SWIFT/BIC MOBKRUMM [UKRAINE-EO13661] (Linked To: SMP BANK).

RESORT NIZHNYAYA OREANDA (f.k.a. FEDERALNOE GOSUDARSTVENNOE BYUDZHETNOE UCHREZHDENIE SANATORI NIZHNYAYA OREANDA UPRAVLENIYA a.k.a. FEDERALNOE GOSUDARSTVENNOE BYUDZHETNOE UCHREZHDENIE SANATORI NIZHNYAYA OREANDA UPRAVLENIYA DELAMI PREZIDENTA ROSSISKOI FE a.k.a. FGBU SANATORI NIZHNYAYA OREANDA a.k.a. SANATORIUM NIZHNYAYA OREANDA), Pgt Oreanda, Dom 12, Yalta, Crimea 298658, Ukraine Resort Nizhnyaya Oreanda, Oreanda, Yalta 08655, Crimea Oreanda - 12, Yalta 298658, Crimea Website http://www.oreanda.biz Email Address [email protected] Registration ID 1149102054221 Tax ID No. 9103006321 Government Gazette Number 00705605 [UKRAINE-EO13685].

STATE CONCERN NATIONAL PRODUCTION AND AGRICULTURAL ASSOCIATION MASSANDRA (a.k.a. MASSANDRA NATIONAL INDUSTRIAL AGRARIAN ASSOCIATON OF WINE INDUSTRY a.k.a. MASSANDRA STATE CONCERN, NATIONAL PRODUCTION AND AGRARIAN UNION, OJSC a.k.a. NACIONALNOYE PROIZ-VODSTVENNO AGRARNOYE OBYEDINENYE MASSANDRA a.k.a. STATE CONCERN NATIONAL ASSOCIATION OF PRODUCERS MASSANDRA), 6, str. Mira, Massandra, Yalta 98600, Ukraine 6, Mira str., Massandra, Yalta, Crimea 98650, Ukraine Mira str, h. 6, Massandra, Yalta, Crimea 98600, Ukraine 6, Myra st., Massandra, Crimea 98650, Ukraine Website http://www.massandra.net.ua/ Email Address [email protected] Registration ID 00411890 (Ukraine) [UKRAINE-EO13685].

STATE ENTERPRISE FACTORY OF SPARKLING WINE NOVY SVET (a.k.a. DERZHAVNE PIDPRYEMSTVO ZAVOD SHAMPANSKYKH VYN NOVY SVIT a.k.a. GOSUDARSTVENOYE PREDPRIYATIYE ZAVOD SHAMPANSKYKH VIN NOVY SVET a.k.a. NOVY SVET WINERY a.k.a. NOVY SVET WINERY STATE ENTERPRISE a.k.a. STATE ENTERPRISE FACTORY OF SPARKLING WINES NEW WORLD a.k.a. ZAVOD SHAMPANSKYKH VYN NOVY SVIT, DP), 1 Shaliapin Street, Novy Svet Village, Sudak, Crimea 98032, Ukraine Bud. 1 vul. Shalyapina Smt, Novy Svit, Sudak, Crimea 98032, Ukraine 1 Shalyapina str. Novy Svet, Sudak 98032, Ukraine Website http://nsvet.com.ua/en/contacts Email Address [email protected] Registration ID 00412665 (Ukraine) [UKRAINE-EO13685].

STATE ENTERPRISE MAGARACH OF THE NATIONAL INSTITUTE OF WINE (a.k.a. AGROFIRMA MAGARACH NATSIONALNOGO INSTYTUTU VYNOGRADU I VYNA MAGARACH, DP a.k.a. DERZHAVNE PIDPRYEMSTVO AGROFIRMA MAGARACH NATSIONALNOGO INSTYTUTU VYNOGRADU I VYNA MAGARACH a.k.a. GOSUDARSTVENOYE PREDPRIYATIYE AGRO-FIRMA MAGARACH NACIONALNOGO INSTITUTA VINOGRADA I VINA MAGARACH a.k.a. MAGARACH AGRICULTURAL COMPANY OF NATIONAL INSTITUTE OF WINE AND GRAPES MAGARACH a.k.a. STATE ENTERPRISE AGRICULTURAL COMPANY MAGARACH NATIONAL INSTITUTE OF VINE AND WINE MAGARACH), Bud. 9 vul. Chapaeva, S.Viline, Bakhchysaraisky R-N, Crimea 98433, Ukraine 9 Chapayeva str., Vilino, Bakhchisaray Region, Crimea 98433, Ukraine 9 Chapayeva str., Vilino, Bakhchisarayski district 98433, Ukraine 9, Chapaeva Str., Vilino, Bakhchisaray Region, Crimea 98433, Ukraine Website http://magarach-institut.ru/ Email Address [email protected] Registration ID 11231070006000476 (Ukraine) Government Gazette Number 31332064 (Ukraine) [UKRAINE-EO13685].

STATE ENTERPRISE UNIVERSAL-AVIA (a.k.a. CRIMEAN STATE AVIATION ENTERPRISE UNIVERSAL-AVIA a.k.a. GOSUDARSTVENNOE UNITARNOE PREDPRIYATIE RESPUBLIKI KRYM UNIVERSAL a.k.a. GOSUDARSTVENNOE UNITARNOE PREDPRIYATIE RESPUBLIKI KRYM UNIVERSAL-AVIA a.k.a. GOSUDARSTVENOYE PREDPRIYATIYE UNIVERSAL-AVIA a.k.a. UNIVERSAL-AVIA, CRIMEA STATE AVIATION ENTERPRISE a.k.a. UNIVERSAL-AVIA, GUP RK), 5, Aeroflotskaya Street, Simferopol, Crimea 95024, Ukraine Registration ID 1159102026742 Tax ID No. 9102159300 Government Gazette Number 00830954 [UKRAINE-EO13685].

TRANSSERVICE LLC (a.k.a. LIMITED LIABILITY COMPANY TRANSSERVIS a.k.a. OBSCHESTVO S OGRANICHENNOI OTVETSTVENNOSTYU TRANSSERVIS (Cyrillic: OБЩЕСТВО С OГРАНИЧЕННОЙ OТВЕТСТВЕННОСТЬЮ ТРАНССЕРВИС) a.k.a. OOO TRANSSERVIS (Cyrillic: ООО ТРАНССЕРВИС)), D. 35 Prospekt Gubkina, Omsk, Omskaya Oblast 664035, Russia [UKRAINE-EO13661] (Linked To: TRANSOIL).

WHITE SEAL HOLDINGS LIMITED, 115 Spyrou Kyprianou Avenue, Limassol 3077, Cyprus [UKRAINE-EO13661].


Éditeurs

DEPUTY EDITORS-IN-CHIEF
Irina V. Goldenkova-Pavlova
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia
Ilya V. Seregin
Dr. Sci. (Biol.), Istitute of Plant Physiology, Moscow, Russia

EDITORIAL BOARD
Nikolaus Amrhein
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Microbiology, Zurich, Switzerland
Suleyman I. Allakhverdiev
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia
Klaus Appenroth
PhD, Institute of General Botany and Plant Physiology, Friedrich-Schiller University, Jena, Germany
Nikolay P. Bityutskii
Dr. Sci. (Biol.), St. Petersburg State University, St. Petersburg, Russia
Thomas Börner
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Biology/Genetics, Humboldt University, Berlin, Germany
Alexander A. Bulychev
Dr. Sci. (Biol.), Moscow State University, Moscow, Russia
Elena V. Deineko
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk, Russia
Christian Dumas
Dr. Sci. (Biol.), French National Institute for Agricultural Research, Lyon, France
Michael A. Hall
Dr. Sci. (Biol.), Aberystwyth University, Aberystwyth, United Kingdom
Andrei U. Igamberdiev
Dr. Sci. (Biol.), Memorial University of Newfoundland, Corner Brook, Canada
Yury V. Ivanov
Cand. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia
Olga V. Karpova
Dr. Sci. (Biol.), Moscow State University, Moscow, Russia
Emil E. Khavkin
Dr. Sci. (Biol.), All-Russia Institute of Agricultural Biotechnology, Moscow, Russia
Yury E. Kolupaev
Dr. Sci. (Biol.), Kharkov University, Kharkov, Ukraine
Vladimir D. Kreslavski
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Fundamental Problems of Biology, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, Russia
Victor V. Kusnetsov
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Moscow, Russia
Nikolai A. Laman
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Experimental Botany, National Academy of Sciences, Minsk, Belarus
Trofim Kh. Maksimov
Dr. Sci. (Biol.), North-Eastern Federal University, Yakutsk, Russia
Alex M. Nosov
Dr. Sci. (Biol.), Moscow State University, Moscow, Russia
Alex V. Nosov
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Moscow, Russia
Ralf Oelmüller
Dr. Sci. (Biol.), Friedrich Schiller University, Jena, Germany
Bart Panis
Dr. Sci. (Biol.), Biodiversity International, Leuven, Belgium
Hugh Pritchard
Dr. Sci. (Biol.), Royal Botanic Gardens, Kew, United Kingdom
Georgy A. Romanov
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Moscow, Russia
Praveen K. Saxena
Dr. Sci. (Biol.), University of Guelph, Guelph, Canada
Henk Schat
Wageningen University, Wageningen, Netherlands
Thomas Schmülling
Dr. Sci. (Biol.), Freie Universität Berlin, Berlin, Germany
Vijay P. Singh
PhD, University of Allahabad, Allahabad, India
Alexei E. Solovchenko
Dr. Sci. (Biol.), Moscow State University, Moscow, Russia
Kazimierz Strzalka
Dr. Sci. (Biol.), Jagiellonian University, Krakow, Poland
Alexander F. Titov
Dr. Sci. (Biol.), Karelian Research Centre, Petrozavodsk, Russia
Tatsuya Tomo
Dr. Sci. (Biol.), Tokyo University of Science, Tokyo, Japan
Marina S. Trofimova
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Moscow, Russia
Igor D. Volotovsky
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Biophysics and Cell Engineering, Minsk, Belarus
Pavel Yu. Voronin
Dr. Sci. (Biol.), Institute of Plant Physiology, Moscow, Russia
Yuri N. Zhuravlev
Dr. Sci. (Biol.), Federal Scientific Center of the East Asia Terrestrial Biodiversity, Vladivostok, Russia


Identification of tissue-specific and common methylation quantitative trait loci in healthy individuals using MAGAR

Fond Understanding the influence of genetic variants on DNA methylation is fundamental for the interpretation of epigenomic data in the context of disease. There is a need for systematic approaches not only for determining methylation quantitative trait loci (methQTL) but also for discriminating general from cell-type-specific effects.

Résultats Here, we present a two-step computational framework MAGAR, which fully supports identification of methQTLs from matched genotyping and DNA methylation data, and additionally the identification of quantitative cell-type-specific methQTL effects. In a pilot analysis, we apply MAGAR on data in four tissues (ileum, rectum, T-cells, B-cells) from healthy individuals and demonstrate the discrimination of common from cell-type-specific methQTLs. We experimentally validate both types of methQTLs in an independent dataset comprising additional cell types and tissues. Finally, we validate selected methQTLs (PON1, ZNF155, NRG2) by ultra-deep local sequencing. In line with previous reports, we find cell-type-specific methQTLs to be preferentially located in enhancer elements.

Conclusion Our analysis demonstrates that a systematic analysis of methQTLs provides important new insights on the influences of genetic variants to cell-type-specific epigenomic variation.


Microbial metabolic response to winter warming stabilizes soil carbon

College of Resources and Environmental Sciences, Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, Beijing, PR China

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Jing Tian, College of Resources and Environmental Sciences Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, 100193, Beijing, PR China.

Guirui Yu, Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), 100101, Beijing, PR China.

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Geography, College of Life and Environmental Sciences, University of Exeter, Exeter, UK

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Key Laboratory of Soil Resource Sustainable Utilization for Commodity Grain Bases of Jilin Province, College of Resource and Environmental Science, Jilin Agricultural University, Changchun, China

Department of Sustainable Agriculture Sciences, Rothamsted Research, Harpenden, UK

Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology and Plant Biology and School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA

Earth and Environmental Sciences, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA

Department of Soil Science of Temperate Ecosystems, University of Göttingen, Göttingen, Germany

Agro-Technological Institute, RUDN University, Moscow, Russia

Institute of Environmental Sciences, Kazan Federal University, Kazan, Russia

College of Resources and Environmental Sciences, Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, Beijing, PR China

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Jing Tian, College of Resources and Environmental Sciences Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, 100193, Beijing, PR China.

Guirui Yu, Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), 100101, Beijing, PR China.

Geography, College of Life and Environmental Sciences, University of Exeter, Exeter, UK

Carbon Management Centre, SRUC-Scotland's Rural College, Edinburgh, UK

College of Resources and Environmental Sciences, Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, Beijing, PR China

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Jing Tian, College of Resources and Environmental Sciences Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, 100193, Beijing, PR China.

Guirui Yu, Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), 100101, Beijing, PR China.

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Geography, College of Life and Environmental Sciences, University of Exeter, Exeter, UK

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Key Laboratory of Soil Resource Sustainable Utilization for Commodity Grain Bases of Jilin Province, College of Resource and Environmental Science, Jilin Agricultural University, Changchun, China

Department of Sustainable Agriculture Sciences, Rothamsted Research, Harpenden, UK

Institute for Environmental Genomics, Department of Microbiology and Plant Biology and School of Civil Engineering and Environmental Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA

Earth and Environmental Sciences, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA, USA

Department of Soil Science of Temperate Ecosystems, University of Göttingen, Göttingen, Germany

Agro-Technological Institute, RUDN University, Moscow, Russia

Institute of Environmental Sciences, Kazan Federal University, Kazan, Russia

College of Resources and Environmental Sciences, Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, Beijing, PR China

Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), Beijing, PR China

Jing Tian, College of Resources and Environmental Sciences Key Laboratory of Plant-Soil Interactions, Ministry of Education, National Academy of Agriculture Green Development, China Agricultural University, 100193, Beijing, PR China.

Guirui Yu, Key Laboratory of Ecosystem Network Observation and Modeling, Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research, Chinese Academy of Sciences (CAS), 100101, Beijing, PR China.

Geography, College of Life and Environmental Sciences, University of Exeter, Exeter, UK

Carbon Management Centre, SRUC-Scotland's Rural College, Edinburgh, UK

Jing Tian and Ning Zong contributed equally to this work.

Résumé

Current consensus on global climate change predicts warming trends with more pronounced temperature changes in winter than summer in the Northern Hemisphere at high latitudes. Moderate increases in soil temperature are generally related to faster rates of soil organic carbon (SOC) decomposition in Northern ecosystems, but there is evidence that SOC stocks have remained remarkably stable or even increased on the Tibetan Plateau under these conditions. This intriguing observation points to altered soil microbial mediation of carbon-cycling feedbacks in this region that might be related to seasonal warming. This study investigated the unexplained SOC stabilization observed on the Tibetan Plateau by quantifying microbial responses to experimental seasonal warming in a typical alpine meadow. Ecosystem respiration was reduced by 17%–38% under winter warming compared with year-round warming or no warming and coincided with decreased abundances of fungi and functional genes that control labile and stable organic carbon decomposition. Compared with year-round warming, winter warming slowed macroaggregate turnover rates by 1.6 times, increased fine intra-aggregate particulate organic matter content by 75%, and increased carbon stabilized in microaggregates within stable macroaggregates by 56%. Larger bacterial “necromass” (amino sugars) concentrations in soil under winter warming coincided with a 12% increase in carboxyl-C. These results indicate the enhanced physical preservation of SOC under winter warming and emphasize the role of soil microorganisms in aggregate life cycles. In summary, the divergent responses of SOC persistence in soils exposed to winter warming compared to year-round warming are explained by the slowing of microbial decomposition but increasing physical protection of microbially derived organic compounds. Consequently, the soil microbial response to winter warming on the Tibetan Plateau may cause negative feedbacks to global climate change and should be considered in Earth system models.

Remarque : L'éditeur n'est pas responsable du contenu ou de la fonctionnalité des informations fournies par les auteurs. Toute question (autre que le contenu manquant) doit être adressée à l'auteur correspondant pour l'article.


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